Fundado por D. João III, em 1540, a sua construção só foi concluída cerca de 80 anos mais tarde, o que contribuiu para a conjugação de diversos estilos.
No conjunto conventual destaca-se a varanda dos reis, com as estátuas dos monarcas que patrocinaram a sua construção - D. João III, D. Sebastião, D. Henrique e D. Filipe I. O templo é composto por dois claustros, tendo um deles um monumental chafariz, enquanto no altar da capela-mor permanece o túmulo de São Gonçalo. A fachada da igreja é grandiosa, com três andares, dois renascentistas e um barroco. (Monumento Nacional)