Instalado na ala sul do Mosteiro dos Jerónimos, foi criado em 1893 pelo Doutor José Leite de Vasconcelos. Reúne material arqueológico da pré e proto-história até à Idade Média e uma colecção de ourivesaria do Calcolítico ao período visigótico. Aqui, para além das exposições temporárias, podemos encontrar permanentemente duas exposições: Tesouros da Arqueologia Portuguesa que tem como objectivo contar a história do povoamento do nosso território, desde as origens até à fundação da nacionalidade e Antiguidades Egípcias com cerca de 300 peças correspondentes a um período de 5000 anos.
Acessos: Autocarros: 14, 27, 28, 29, 43, 49, 51 e 73. Eléctrico: 15. Comboio: Belém (Linha de Cascais). Barcos: Estação Fluvial de Belém: barcos da Trafaria e Porto Brandão
