Pioneiro em Portugal, este museu pretende ser um espaço pedagógico-didáctico sobre o Judaísmo e a cultura do povo judeu. Ilustra a história dos judeus portugueses, as suas vicissitudes ao longo dos tempos e o contributo que trouxeram à cultura, arte, literatura, comércio e ofícios,
O espaço está dividido em três pisos. No primeiro existe um átrio/recepção, a loja do museu e um auditório; no segundo encontra-se a exposição permanente; enquanto o terceiro destina-se a exposições temporárias e a um Centro de Estudos Judaicos. O museu foi renovado em 2017.