Após a restauração da independência, a perspectiva de uma longa guerra com Espanha levou à fortificação da barra de Lisboa e de Cascais em particular. Foi erguida uma praça-forte vizinha do mar que se ligou à já existente pequena fortaleza de Nossa Senhora da Luz. Sofreu grandes obras após o terramoto de 1755. Em 1871 D. Luís adaptou o antigo palácio do governador militar a residência de Verão da família real, passando, em 1963, a residência de Verão do presidente da República. No interior do forte existe ainda a capela de Nossa Senhora da Vitória. Decorre a adaptação de parte da Cidadela a Pousada.
Ocupação actual: Instalações da Presidência da República