Inicialmente fundada devido à aparição de uma imagem da Virgem Maria, a igreja foi reconstruída em 1560, por ordem do Cardeal D. Henrique, tendo como inspiração a Igreja de Santo Antão de Évora. Conta no seu interior com dez capelas, sendo que cada uma delas pertence a uma irmandade distinta. Destaca-se a Capela das Almas com três alteres de mármore.
