Após o terramoto de 1755, a igreja foi reconstruída por Manuel Caetano de Sousa, que aproveitou o portal e a sacada sobrejacente que foram salvos da Capela-Real do Paço da Ribeira. Em 1959 um incêndio destruiu o seu interior. (Monumento Nacional).Esta igreja é a igreja paroquial de Santa Justa e Rufina.
