Esta igreja fazia parte do antigo Convento de São Francisco e terá tido uma origem medieval, como o atestam o portal gótico e as abóbadas decoradas com ogivas estreladas. Ao longo dos séculos foi, por diversas vezes, intervencionada. De uma só nave, tem bonitas capelas tumulares do século XVI, sendo o altar-mor revestido a talha dourada. Em 1834, depois da extinção das ordens religiosas, o convento e a igreja foram comprados pelo Comendador José Mendes Veiga que ofereceu esta última à freguesia de Nossa Senhora da Conceição. A 19 de Agosto de 1851 um incêndio devorou o convento, cuja área e claustro ocupavam aproximadamente a área do actual Jardim Público, Largo da Infantaria 21 e Rua Nogueira de Frades. Apesar do restauro que sofreu após o incêndio, a fachada preserva ao nível superior do alçado o formulário decorativo do barroco.
