Considerado património nacional foi mandado construir pela rainha D. Leonor em 1518. Destinava-se a albergar as freiras capuchas de Santa Clara. Mais tarde D. Catarina mandou prosseguir as obras contratando o arquitecto Afonso Pires. A construção do Convento na sua totalidade teve lugar apenas em 1550 e passou a designar-se Convento das Freiras. Actualmente alberga o Museu Arqueológico e Lapidar Infante D. Henrique. É um edifício com características renascentistas, já a igreja é manuelina. O claustro, do tipo coimbrão, tem dois andares, sendo o inferior de arcadas de volta inteira com tramos de dois arcos separados por botaréus encimados de gárgulas, e, o superior tem colunas jónicas. Na fachada, o portal data de 1539, tendo sido o edifício planeado pelo Mestre Afonso Pires.
