Construída de costas para o mar, sobre uma antiga igreja gótica, a Sé Catedral é uma imponente construção quinhentista com moldes da arquitectura filipina. Aqui merece especial atenção a capela-mor e o seu interior com tecto esculpido em cedro, bem como belos azulejos, pinturas e pratas do século XVII, a sacristia com móveis em jacarandá e retratos a óleo. Neste templo de grandes dimensões, centro da forte religiosidade açoriana, está sepultado Pero Anes do Canto, antigo provedor das fortificações da ilha Terceira.
A sé sofreu com o terramoto de 1980 e com um grande incêndio que a devastou pouco depois, determinando a sua configuração actual. Encontra-se classificada como Monumento Regional.