O actual templo episcopal teve dois antecessores, o mais antigo dos quais terá sido construído sensivelmente na sua actual localização, durante o século XIII. Um segundo templo chegou a ser construído fora das muralhas do burgo, onde hoje se ergue a igreja da Misericórdia. O actual edifício começou a ser construído em 1390, no reinado de D. João I. Como a construção decorreu ao longo de quase dois séculos (até 1540), podem observar-se diferentes estilos arquitectónicos, do românico, ao gótico e ao manuelino.
Interiormente há três naves e a grande jóia é o retábulo em pedra de Ançã atribuído a João de Ruão. Desdobrando-se em seis andares tem como tema a Paixão e Morte de Cristo, sendo considerado uma obra-prima da escultura do século XVI.