Instalado no antigo hospital da Misericórdia de Aljezur, o museu possui o espólio da Misericórdia de Aljezur, da Paróquia de Nossa Senhora da Alva e algumas ofertas e aquisições. As diferentes peças estão distribuídas por vitrines de acordo com o Tempo Litúrgico da Igreja Católica (Advento, Natal, Tempo Comum, Quaresma e Semana Santa, Páscoa, Pentecostes e Tempo Comum), com especial destaque para a vitrine que contém objectos pessoais e outros do patrono do museu.